基于下一代测序的新型HPV基因分型检测的开发和验证
Abstract
在大规模的宫颈癌筛查中，基于多重聚合酶链反应和下一代测序（NGS）方法，我们研发了一种新的人类乳头状瘤病毒（HPV）基因分型检测。
首先，我们检测自收集的1170例样本，选取了高危类型的阈值。然后选用4262例单独的自收集样本，对宫颈上皮内瘤变型2（CIN2）或更高和CIN3型（CIN3）或更高的类型，联合第二代杂交捕获（HC2）直接检测样品的HPV测序分析及基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱检测自身样本，比较检测的一致性，敏感性和特异性。
结果：所有检测有良好的一致性。对CIN2或更高及CIN3或更高的自身样本，应用在MiSeq和Ion Yorrent 个人基因组测序仪上的测序检测与HC2直接处理样本的敏感性相似（P > .05），但是测序的特异性显著高于HC2(P < .01).
结论：基于人口检测的研究证明，对于自收集的原发宫颈癌筛查来说，新的NGS高危HPV检测是适用的。
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