荧光PCR-优化寡核苷酸探针法与Sanger测序法检测肺癌、结直肠癌患者KRAS基因突变的对比分析

邱田(100021,中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科);凌云(100021,中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科);陈钊(清华大学生命科学学院);山灵(100021,中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科);郭蕾(100021,中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科);吕宁(100021,中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科);应建明(100021,中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科);

阅读：327 中华病理学杂志； 2012年41卷9

摘要

目的对荧光PCR-优化寡核苷酸探针法与Sanger测序法检测肺癌、结直肠癌患者KRAS基因突变阳性率、符合率进行对比分析,探讨荧光PCR-优化寡核苷酸探针法检测KRAS基因突变的临床应用特点.方法收集221例肺腺癌、131例结直肠癌标本.所有标本均经4％中性甲醛固定、石蜡包埋、组织切片后评估肿瘤细胞含量,必要时行刮取富集肿瘤细胞后提取基因组DNA,采用荧光PCR-优化寡核苷酸探针法及Sanger测序法检测标本中KRAS基因突变.统计两种方法检测突变阳性率、突变类型、与患者特征相关性及符合率等.结果 221例肺癌标本中通过荧光PCR-优化寡核苷酸探针法及Sanger测序法检出 KRAS基因突变阳性率分别为6.3％ (14/221)、4.5％(10/221);131例结直肠癌标本中检出 KRAS基因突变阳性率分别为41.2％ (54/131)、40.5％(53/131).不论何种方法检测KRAS基因突变阳性率均与患者性别、年龄无关(P＞0.05).两种方法检测KRAS基因突变的阳性率差异无统计学意义(P＞0.05).结直肠癌KRAS基因突变率显著高于肺癌(P＜0.01).KRAS基因第12位密码子突变比例显著高于第13位密码子(P＜0.05).两种方法检测结果总体符合率为97.4％.结论荧光PCR-优化寡核苷酸探针法检测肺癌、结直肠癌患者KRAS基因突变检出率与Sanger测序法相当,可作为Sanger测序法之外的基因突变检测的备选方法.

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