王东(200241,基因科技上海有限公司研发中心);梁旺(200241,基因科技上海有限公司研发中心);段笑微(200241,基因科技上海有限公司研发中心);刘玲(200241,基因科技上海有限公司研发中心);申浩(200241,基因科技上海有限公司研发中心);彭永济(200241,基因科技上海有限公司研发中心);李宾(200241,基因科技上海有限公司研发中心);
摘要
目的检测中国结直肠癌患者中KRAS基因的突变率,分析KRAS基因的突变类型以及突变地区分布差异。方法收集2009至2013年间,来自全国27个省、市、自治区的6364例结直肠癌肿瘤组织标本,采用焦磷酸测序法检测标本中KRAS基因第12和13位密码子的突变状态,分析KRAS基因突变类型及KRAS基因突变在中国人群中的地区分布差异。结果中国结直肠癌患者中KRAS基因突变发生率为37.43%(2382/6364)。检测到10种KRAS基因单碱基突变类型,共计2369例,其中6种为常见突变类型,分别为12GGT>GAT (14.77%)、13GGC>GAC(8.19%)、12GGT>GTT(7.89%)、12GGT >TGT(2.20%)、12GGT >AGT (2.00%)和12GGT >GCT(1.48%),余下12GGT>CGT、13GGC>TGC、13GGC>CGC和13GGC>AGC四种突变类型的发生率较低(<1%)。另外还检测到8种特殊突变类型共计13例。不同地区来源的样本中, KRAS 基因的突变率为35.68%~38.04%,但不同地区间KRAS基因的突变率差异无统计学意义( P>0.05)。结论在中国结直肠癌患者中,KRAS基因突变类型丰富。其中6种为常见突变类型,突变发生率不低于1%。结直肠癌患者的KRAS基因突变率不存在显著的地区差异。焦磷酸测序法可以快速准确地鉴别结直肠癌组织样本中的KRAS基因突变状态,在临床上有着良好的应用前景。
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