目的 应用免疫组化和实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)技术检测结直肠癌中BRAF V600E突变,比较这两种技术在结直肠癌中的应用价值.方法 总结113例结直肠癌标本BRAF V600E免疫组化和qRT-PCR的结果 ,以测序为金标准,评价这两种技术在结直肠癌BRAF V600E突变检测中的应用价值.结果 113例结直肠癌标本中,免疫组化检测阳性19例,阴性82例,不确定诊断12例.其中19例阳性标本经测序确认BRAF V600E突变6例,未突变13例;12例不确定诊断病例经测序确认1例突变,11例未突变.免疫组化阳性检出率为16.81％,阴性检出率为72.57％,不确定诊断例数占检测例数的10.62％.113例结直肠癌标本同时行qRT-PCR检测,结果 突变7例,未突变106例,阳性检出率为6.19％,阴性检出率为93.8％,无不确定诊断,与测序结果 一致,符合率达100％.以测序为金标准,比较这两种技术在结直肠癌检测BRAF V600E中的应用价值,免疫组化和qRT-PCR技术的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、假阴性率、假阳性率、准确率分别为100％、86.32％、31.58％、100％、0、13.68％、87.13％和100％、100％、100％、100％、0、0、100％.经配对χ2检验这两种检测方法差异有显著性(P<0.00001).结论 在结直肠癌BRAF V600E检测中,qRT-PCR较免疫组化有更高的准确性.