不同转移潜能鼻咽癌细胞株的差异膜蛋白质组研究
摘要
目的:采用定量蛋白质组学技术筛选鼻咽癌转移相关的膜蛋白质.方法:在富集高转移鼻咽癌细胞株5-8F和不转移鼻咽癌细胞株6-10B膜蛋白质的基础上,采用稳定同位素18O标记结合串联质谱技术比较两株细胞膜蛋白质组的差异,采用Western印迹对差异表达膜蛋白质EphA2的表达水平进行验证,采用生物信息学方法对差异蛋白质进行GO(gene oncology)功能聚类和全基因组及代谢途径数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路分析.结果:鉴定了31个5-8F与6-10B细胞的差异膜蛋白,其中25个蛋白质在5-8F中表达上调、6个蛋白质表达下调,Western印迹技术验证了差异膜蛋白质EphA2的表达.生物信息分析显示,差异膜蛋白的功能主要涉及细胞黏附、受体再循环和细胞连接等生物学过程,并参与了14个KEGG通路,其中许多通路涉及细胞黏附、细胞连接以及细胞运动.结论:31个差异膜蛋白质可能在鼻咽癌转移过程中发挥重要作用,为进一步研究鼻咽癌转移的分子机制提供了新线索.
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