胰腺癌中miR-27a靶基因PSMA1的预测及鉴定

张婷婷(100730,中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科);孙洋(100730,中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科);贾丛伟(100730,中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科);于双妮(100730,中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科);卢朝辉(100730,中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科);陈杰(100730,中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院病理科);

阅读：818 中华病理学杂志； 2013年42卷6

摘要

目的软件预测并筛选miR-27a可能的靶基因,结合胰腺癌比较蛋白质组学结果中表达下调的蛋白,进一步检测胰腺癌中miR-27a的靶基因并进行验证.方法采用生物信息学预测软件TargetScan、PicTar以及miranda预测miR-27a的靶基因,结合前期比较蛋白质组学的结果,筛选出miR-27a的可能靶基因；构建靶基因3'非翻译区(UTR)的表达载体,双荧光素酶报告基因检测系统验证miR-27a对靶基因的靶向作用；胰腺癌肿瘤细胞系PANC-1和BxPC-3中转染miR-27a mimics或微小RNA阴性对照序列,Western blot检测靶蛋白的表达情况.结果软件预测与蛋白质组学分析结合筛选出miR-27a的靶基因为PSMAl.双荧光素酶报告基因检测系统显示,与对照组相比miR-27a对野生型PSMA1的3'UTR具有靶向作用,实验组较阴性对照组相对活性值下降19.14％,差异具有统计学意义(P=0.016)；而对突变型PSMA1 3'UTR的靶向作用消失,实验组与阴性对照组相比差异无统计学意义(P=0.249).Western blot分析显示转染miR-27a mimics组PSMA1蛋白的相对表达量明显低于阴性对照组,PANC-1细胞实验组的PSMA1相对表达量为0.71±0.01;BxPC-3细胞实验组的PSMA1相对表达量为0.58±.0.04,P值均＜0.01.结论胰腺癌中PSMA1是miR-27a的直接靶基因.

全文链接

胰腺癌中miR-27a靶基因PSMA1的预测及鉴定

摘要

摘要

我要评论

共0条评论

本期排行