无论是从组织病理学还是从细胞学来说，鉴别恶性间皮瘤与间皮细胞反应性增生都是极其困难的。最近，BRCA1相关蛋白1（BAP1）基因变异导致核蛋白缺失在遗传性和散发性间皮瘤都有报道。我们收集了大宗活检标本，包括212例间皮瘤、12例良性间皮肿瘤和42例反应性间皮增生，利用免疫组化方法，检测了BAP1表达对间皮瘤与其他间皮细胞增生的鉴别诊断价值。同时也对70例细胞学标本（包括45例间皮瘤和25例反应性间皮增生）进行了BAP1染色。BAP1在所有良性间皮细胞肿瘤中表达，而139 / 212（66%）间皮瘤BAP1为阴性，尤其是上皮/双相型与肉瘤样/促结缔组织增生性亚型相比（69% vs 15%）。BAP1缺失除两例上皮样恶性间皮瘤显示为杂合性外，其余肿瘤细胞均显示为纯合性。荧光原位杂交技术证实，绝大多数BAP1阴性肿瘤（31/41，76%）BAP1蛋白丢失同时，存在BAP1基因位点纯合性缺失，而9/10 BAP1阳性间皮瘤均正常。活检诊断为反应性间皮增生伴BAP1缺失的病例100%为恶性肿瘤前兆，因为所有6例病例最后均进展为BAP1阴性间皮瘤，而只有3/ 36（8%）BAP1阳性病例进展为间皮瘤。细胞学/细胞块标本，良性间皮细胞总是BAP1阳性，而64%的间皮瘤显示BAP1蛋白质缺失；6例细胞学BAP1阴性的病例组织学诊断为BAP1阴性间皮瘤。BAP1染色对间皮瘤与胸膜和腹膜常见类似病变，如肺癌和卵巢癌的鉴别诊断也有一定价值，其特异性和敏感性分别为99/70%和100/70%。我们的研究结果表明，间皮瘤尤其是上皮样/双相型间皮瘤常常显示BAP1蛋白缺失，通常与BAP1纯合性缺失相关。BAP1免疫染色对良、恶性间皮增生性病变的鉴别诊断是一个前所未有的特异性好（100%）的标志物。间皮细胞发现BAP1缺失应立即重新检查患者；此外，它还可用于确定肿瘤程度和计划手术切除范围。