基于数据挖掘分析非小细胞肺癌中RPA3的表达及其临床意义
摘要
目的:探索复制蛋白A(replication protein A,RPA)3在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达及意义.方法:利用BioGPS数据库检索RPA3在正常组织中的表达;使用Oncomine数据库分析关于RPA3基因的信息,并对RPA3基因在肺癌中的表达进行荟萃分析;利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析RPA3表达对NSCLC患者生存时间的影响;String-DB数据库分析与RPA3相互作用的蛋白.结果:RPA3在人体正常组织中均有表达.与正常肺组织相比,NSCLC组织中RPA3基因在mRNA水平呈高表达(P＜1E-5).RPA3基因的高表达与NSCLC患者的总体生存期(overall survival,OS)呈负相关(HR=1.48,P=2.2E-09).亚组分析显示:RPA3高表达水平对肺腺癌患者OS有显著影响(HR=2.09,P=3.4E-09),而在鳞癌患者中,其表达水平对OS无显著影响(HR=0.97,P=0.77). MCM2,ORC2,ORC3,PCNA,POLD1,PRIM1,RFC4,RPA1,RPA4等基因与RPA3有明显的相互作用.结论:通过肿瘤基因数据库信息挖掘表明,RPA3在NSCLC组织中呈高表达,且与患者预后相关,为深入研究RPA3在NSCLC发生发展中的作用提供重要理论依据.
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