胃癌组织microRNA表达谱检测及生物信息学分析
摘要
目的 探讨微小RNA(microRNA,miRNA)在胃癌组织中的表达特征.方法 采用Exiqon miRNA芯片检测3对胃癌组织及其配对正常胃黏膜组织中miRNA差异表达情况,随机选取10个上调或下调差异表达的miRNA应用qPCR技术验证;应用生物信息学分析差异表达的miRNA及其靶向基因在胃癌发生、发展中的作用.结果 芯片结果显示,在3对胃癌组织中有111个miRNA出现差异表达(差异倍数＞2,P＜0.05),其中上调表达95个,下调表达16个.进一步行qPCR验证的10个miRNA的表达情况与miRNA芯片结果一致(P =0.040).聚类分析显示胃癌组织与癌旁组织存在明显的差异表达,基因本体(gene ontology,GO)及pathway分析显示差异表达的miRNA涉及胃癌的凋亡、周期转换、分化、侵袭、转移及各种肿瘤通路的激活等.结论 胃癌组织中miRNA存在异常表达,可能涉及胃癌的发生、发展.
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