目的:通过蛋白质组学筛选和验证肾透明细胞癌中潜在肿瘤标志物.方法:采用比较蛋白质组学方法筛选正常肾组织和肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)组织中的差异表达蛋白,通过二维差异凝胶电泳(two-dimensional difference gel electrophoresis,2D-DIGE)和傅里叶变换离子回旋共振质谱(Q-Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry,FT-ICR MS)分离并鉴定16例RCC组织及其相应的正常组织中差异显著的蛋白,并进一步通过实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)、Western印迹和免疫组织化学在RNA和蛋白水平进行验证.结果:通过2D-DIGE共筛选出1 873个蛋白质点,选取68个表达差异大于1.5倍的蛋白质点进行鉴定,成功鉴定出51个蛋白质(P＜0.05),其中16个蛋白表达上调,35个表达下调.采用qRT-PCR和Western印迹验证16例肿瘤和对照组织,结果表明在肿瘤组织中NNMT和Annexin Ⅳ表达显著升高,而ACY1和Calbindin显著下调(P＜0.01).同时针对ACY1和Annexin Ⅳ蛋白分别在53例和47例样本中进行免疫组织化学,结果显示相较于对照组织,ACY1在肾透明细胞癌中表达显著降低(P＜0.001),而Annexin Ⅳ显著升高(P＜0.001).结论:ACY1和Annexin Ⅳ可作为肾透明细胞癌的肿瘤标志物.