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一种从石蜡包埋组织中快速提取DNA的方法

张惠丹(中国医科大学卫生部细胞生物学重点实验室、医学细胞生物学教育部重点实验室、细胞生物学教研室,沈阳,110001);任辉(沈阳市肛肠医院大肠外科,沈阳,110002);王晓楠(中国医科大学卫生部细胞生物学重点实验室、医学细胞生物学教育部重点实验室、细胞生物学教研室,沈阳,110001);方瑾(中国医科大学卫生部细胞生物学重点实验室、医学细胞生物学教育部重点实验室、细胞生物学教研室,沈阳,110001);

摘要

目的 建立从甲醛固定石蜡包埋组织中高效、快速提取基因组DNA的方法.方法 将一片10 μm厚石蜡包埋大肠癌组织切片直接浸入150 μl消化液中,56 ℃孵育0.5 h、1 h和2 h,灭活蛋白酶K后离心取上清即为DNA提取物.琼脂糖凝胶电泳检测所提取DNA的片段分布,紫外分光光度法测定DNA的产量及纯度.以提取的DNA为模板,PCR扩增不同长度产物片段并进行产物的直接测序以评价提取方法.结果 该提取方法能够获得较长片段的基因组DNA,从一片10 μm厚石蜡切片中即可获得大约60 μg的DNA,在0.5 h消化条件下获取的模板DNA,即可实现对152 bp、293 bp、392 bp和541 bp等4种不同片段的100%扩增,1 h消化组的PCR产物可直接用于DNA测序.结论 建立了一种简单、快速地从甲醛固定石蜡包埋组织中提取DNA的方法,只需一步消化即可获得满足普通PCR及测序需要的基因组DNA.

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