应用表达芯片筛选小鼠肝癌淋巴道转移相关基因

宋波(大连医科大学病理学教研室,大连,116011);王波(大连医科大学病理学教研室,大连,116011);崔晓楠(大连医科大学附属第一医院肿瘤科,大连,116011);侯力(大连医科大学病理学教研室,大连,116011);周春辉(大连医科大学病理学教研室,大连,116011);郑仁恕(大连医科大学病理学教研室,大连,116011);李晓枫(大连医科大学流行病学教研室,大连,116027);唐建武(大连医科大学病理学教研室,大连,116011);

阅读：327 临床与实验病理学杂志； 2005年21卷6

摘要

目的采用表达芯片比较高、低淋巴道转移力小鼠肝癌腹水型细胞株Hca-F和Hca-P的基因表达谱,以筛选出与肿瘤淋巴道转移相关的基因.方法分别提取Hca-F和Hca-P细胞的总RNA,反转录合成生物素标记的cRNA探针,并与Affymetrix GeneChip MOE430A(包括22 690个转录本,对应于约14 500个小鼠已知基因和4 371个EST)杂交,检测结果利用生物信息学进行分析.结果 Hca-F和Hca-P相比,在14 500个已知基因中,有901个(6.2%)表达上调幅度≥2倍;在4 371个EST中,有129个(3%)上调幅度≥2倍.公布了差异表达≥8倍的37个基因并根据Gene Ontology(GO)分类和TreeView分析,按照其参与的生物学过程和具有的分子功能进行了功能分类.其中有19个基因参与了组织发生、细胞黏附、信号转导、细胞生长、分化及代谢等的生物学过程,29个基因分别具有转运、移动、蛋白激酶、蛋白结合及受体活性等分子功能,7个基因的生物学功能尚不清楚.结论表达芯片检测与肿瘤淋巴道转移模型相结合,为肿瘤转移研究提供新方法、新思路,一些过量表达的基因将为肿瘤转移机制的研究提供新线索.

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