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基因芯片在宫颈癌、卵巢癌和乳腺癌相关基因表达研究中的运用

易广才(南京市妇幼保健院,南京,210004南京师范大学生命科学学院,南京,210097);单祥年(南京师范大学生命科学学院,南京,210097);邵振堂(南京市妇幼保健院,南京,210004);

摘要

目的应用基因微矩阵芯片筛查妇科恶性肿瘤相关基因表达.方法分别提取癌组织和正常对照组织mRNA,分别用Cy3-dCTP和Cy5-dCTP经反转录荧光标记cDNA,获得两组探针,将探针混合后与基因芯片H40s(基因点数为4 096点,上海联合基因公司提供)杂交,经严格洗片后用GenePix4000B扫描仪进行扫描,获得荧光信号图像,用GenePix Pro3.0图像处理软件对图像进行处理,获得两种组织中差异表达的基因信息.结果在子宫颈癌组织中差异表达的基因24.61%(1008/4 096),其中表达降低(下调趋势)占11.28%(462/4 096);表达增高(上调趋势)占13.32%(546/4096).在卵巢癌组织中差异表达的基因24.02%(984/4096),其中表达降低(下调趋势)占12.67%(519/4096),表达增高(上调趋势)占11.35%(465/4 096);在乳腺癌组织中差异表达的基因占9.67%(396/4096),其中表达降低(下调趋势)占4.59%(188/4096),表达增高(上调趋势)的5.08%(208/4096).在3种癌组织中同时出现表达差异的基因有1.37%.结论子宫颈癌、卵巢癌和乳腺癌有多种基因表达失衡.

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