累及左右结肠的常见腺瘤中DNA甲基化的不同模式

Duke WH,Sherrod TT,Lupton GP

阅读：1 American Journal of Surgical Pathology； Volume 24, June 2000, Issue 6

Abstract

近期研究表明在结直肠癌中存在两种不同的非CIMP甲基化群，进一步提高了包括CIMP基因在内的DNA甲基化在常见的腺瘤-癌通路中可能发挥重要作用的可能性。应用Illumina公司人类甲基化450微芯片对135例腺瘤（65例左半结肠，70例右半结肠）的表观基因组DNA甲基化进行评估。应用基本成分分析来检测DNA甲基化变化与腺瘤位置间的关系。应用线性回归和线性混合效应模式来识别左、右结肠腺瘤中特定基因DNA甲基化的差别。即便在进行了年龄和性别校验 (P=0.009)后，最主要的成分和腺瘤定位仍显示出明显的相关性 (P=0.007)。左、右结肠腺瘤间共有168个 CpG位点的甲基化有差异，而且这些位点表现出同源基因的聚集 (P=3.0 × 10(-12))。168种探针无一种与 CIMP基因相关。在左、右结肠腺瘤甲基化差异最大的CpG位点中，在右结肠腺瘤中与 PRAC（前列腺癌易感候选）基因相关的探针表现出甲基化，而在左结肠腺瘤中则是与CDX2（尾型同源框转录因子2）相关的探针显示出甲基化。左结肠腺瘤中嗜烟者亚组 (OR=6.1, P=0.004)显示出与右结肠腺瘤相同的甲基化特征。总之，我们的结果表明了在左、右结肠腺瘤中，独立于CIMP基因的DNA甲基化的不同模式。

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累及左右结肠的常见腺瘤中DNA甲基化的不同模式

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