2013年CAP/ASCO HER2检测指南更新修订了HER2 FISH分类，比如一些“单倍体”、“共同扩增/多倍体”的病例。低水平增加的HER2信号或集群的异质性现在被认为是扩增的或不确定的。这项研究发现了乳腺癌HER2 FISH检测中有着大量的不确定或“非经典”结果的病例及其临床病理特征。这项研究收集了三家机构（Stanford, UCSF, UWMC）从2001年至2014年的乳腺癌病例，收集的指标包括HER2 FISH结果、HER2 免疫组织化学结果、ER、组织学分级以及年龄。HER2 FISH结果的判读使用更新后的推荐规范。“非经典”结果的病例被分为以下几个组：（1）“单倍体”组（比率≥2.0，平均HER2拷贝数／细胞<4.0）；（2）“共同扩增”组（比率<2.0，平均HER2拷贝数／细胞≥6.0）；（3）“低水平扩增”组（比率≥2.0，平均HER2拷贝数／细胞 4.0-5.9）。有成簇的HER2阳性细胞聚集的异质性病例也囊括在内。在8068例病例中，5.2%为不确定结果，4.6%为“非经典”HER2 扩增结果；其中1.4%为“单倍体”，0.8%为“共同扩增”，2.1%为“低水平扩增”，以及0.3%为成簇的异质性病例。这些癌症病例有着很高的ER阳性率（80.4%），Nottingham3级的结果约占52.1%。在“共同扩增”组中，3级癌症(66.7%)及HER2免疫组织化学法阳性结果(31.7%)所占的比例最高。在“单倍体”组中，1级癌症(13.3%)及HER2免疫组织化学法阴性结果 (30.1%)所占的比例最高。不确定的病例与“低水平扩增”组的病例有着极为相似的特征。“非经典”结果或不确定结果的病例都是典型的ER阳性、组织学级别更高的癌症。共同扩增”组的癌症常常更具有侵略性，而“单倍体”组往往有着更低的风险特征。目前尚无这些HER2 FISH检测“非经典”结果病例的临床结局数据，我们的研究结果通过逐个关联附加的临床-病理因素，为目前的HER2 FISH分类提供了支持，也为评估是否对这些非经典病例进行HER2靶向疗法提供了依据。